将flatfiles加载到规范化的MySQL数据库中

将数据从flatfiles加载到MySQL数据库,然后通过外键创建表之间的关系的最快方法是什么？

例如......我有一个平面文件格式:

[INDIVIDUAL]   [POP]  [MARKER]  [GENOTYPE]

"INDIVIDUAL1", "CEU", "rs55555","AA"  
"INDIVIDUAL1", "CEU", "rs535454","GA"  
"INDIVIDUAL1", "CEU", "rs555566","AT"  
"INDIVIDUAL1", "CEU", "rs12345","TT"  
...  
"INDIVIDUAL2", "JPT", "rs55555","AT"  

我需要加载到四个表中:

IND (id,fk_pop,name)  
POP (id,population)  
MARKER (id,rsid)  
GENOTYPE (id,fk_ind,fk_rsid,call)  

具体来说,如何以缩放的方式填充外键？这些数字在1000多个人的范围内,每个人有100万+基因型.

我会采取多步骤的方法来做到这一点.

将数据加载到临时表中,该表与您拥有的文件格式匹配

编写查询以执行其他插入,启动常规表,然后执行连接以获取FK值.