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批处理:GNU-make,Snakemake还是什么?

如何解决《批处理:GNU-make,Snakemake还是什么?》经验,为你挑选了1个好方法。



1> Toby Speight..:

我对Snakemake一无所知,但在GNU Make中你可以转换in_filesout_files:

in_files = $(wildcard *.IN)
out_files = $(in_files:.IN=.out)

然后你制作一个取决于所有输出的虚拟目标:

all: $(out_files)
.PHONY: all

最后,从一个输入创建一个输出的规则:

%.out: %.IN
    matlab -nosplash -nodesktop -r "a_matlab_function('$<','$@')"


这比上面的_bash_脚本好很多*.它会检查返回值.您可以再次运行它,它只会重新转换已更改的文件.它将使用_all_你的CPU是你很好地问_make_.
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