我正在尝试rbind一个大型数据帧列表(outputDfList),该列表是通过将一个复杂的函数应用到大型表而生成的。您可以通过以下方式重新创建outputDfList:
df1=data.frame("randomseq_chr15q22.1_translocationOrInsertion", "chr15", "63126742") names(df1)=NULL df2=df1=data.frame("chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion", "chr18 ", "63126741") names(df2)=NULL outputDfList=list(df1,df2)
我的代码是
do.call(rbind, outputDfList)
我收到的错误消息:
Error in pi[[j]] : subscript out of bounds
我仔细检查了每个数据框的列号,它们都相同。我还尝试使用“ options(error = recover)”进行调试,但是我对它的熟悉程度不足以解决确切的问题。任何帮助表示赞赏。谢谢。
更新之后,看来您的问题是列名无效:数据框列名必须为非空。
更正此错误后,代码即可工作:
for (i in seq_along(outputDfList)) { colnames(outputDfList[[i]]) = paste0('V', seq_len(ncol(outputDfList[[i]]))) } do.call(rbind, outputDfList) # V1 V2 V3 # 1 chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion chr18 63126741 # 2 chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion chr18 63126741
但是,我很困惑这种情况最初是如何发生的。此外,我在代码中收到的错误消息仍然与您的代码不同:
match.names(clabs,names(xi))中的错误:
名称与以前的名称不匹配