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ggplot2:将geom_dotplot与facet_grid一起使用时,没有自由轴缩放

如何解决《ggplot2:将geom_dotplot与facet_grid一起使用时,没有自由轴缩放》经验,为你挑选了0个好方法。

我一直试图使用facet_grid一起生成一系列点图.这样做,我注意到geom_dotplot似乎没有响应facet_grid的scales ="free_y"参数.

这是一些示例代码:

require(ggplot2)

#Example data
set.seed(3)
df = data.frame(Gene = rep(c("a", "b", "c", "d"), each=20),
                ToD = rep(c("Morning", "Evening"), times = 40),
                Expression = c(runif(20, min=0, max=10),
                               runif(20, min=0, max=1),
                               runif(20, min=0, max=1000),
                               runif(20, min=0, max=100)))

#Box plots of example data
ggplot(df, aes(x = ToD, y = Expression)) +
    geom_boxplot() +
    facet_grid(Gene ~ ., scales = "free_y")

#Dot plots of example data
ggplot(df, aes(x = ToD, y = Expression)) +
    geom_dotplot(binaxis = "y", stackdir = "centerwhole") +
    facet_grid(Gene ~ ., scales = "free_y")

这里是我正在使用的R和ggplot2的版本:

R版本3.2.2(2015-08-14)

ggplot2_1.0.1.9003

因此,当我生成箱形图时,一切都按预期工作,y轴适当地缩放为每个构面行:

测试数据的箱形图

但是,点图对于每个构面行保持相同的y轴刻度:

测试数据的点图

我已经读过ggplot2中的一个已知错误,其中coord_flip和facet_grid在指定自由比例时不能一起工作.这与同样的问题有关吗?

虽然我可以单独生成每个图,然后将它们与grid.arrange结合使用,但这对我的目的来说很麻烦.我试图将这些点图与其他刻面图拼接在一起,我想避免使用grid.arrange重新生成所有这些图.有什么想法吗?

感谢您提供的任何帮助,如果我能提供任何进一步的说明,请告诉我.

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