在给定时间后打破专有工具箱

我每次都在MATLAB中迭代一个大的测试矩阵并调用第二方专有软件(在MATLAB中运行).我无法编辑软件源代码.有时候,软件会挂起,所以我想在一段时间后退出它并继续下一次迭代.

在伪代码中,我这样做:

for i = 1:n
    output(i) = proprietary_software(input(i));
end

output(i)='too_long'如果专有软件耗时太长,我怎样才能跳到下一次迭代(并可能保存)？